More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2211 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2211  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.5 
 
 		 584 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  37.61 
 
 		 619 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1322 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 437 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 200 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  40.4 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 		 488 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0984  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.17 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.194443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 566 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 553 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 437 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.61 
 
 		 457 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1702  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 239 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 239 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.82 
 
 		 593 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.82 
 
 		 593 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  36.36 
 
 		 457 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2179  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 348 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 492 aa  72  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  33.88 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 440 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  34.75 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 397 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  35.54 
 
 		 457 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  35.04 
 
 		 254 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.71 
 
 		 529 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  34.78 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  33.06 
 
 		 455 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  32.73 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  37.17 
 
 		 269 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  32.23 
 
 		 285 aa  70.5  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 503 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1361 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  34.19 
 
 		 226 aa  70.1  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  34.71 
 
 		 705 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1005 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2384  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  35.05 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 974 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0515999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.62 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 806 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1834  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00302805 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5729  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  35.04 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  35.04 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 433 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>