285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1739 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 540 aa  1093    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  54.55 
 
 		 715 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  42.4 
 
 		 517 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  43.79 
 
 		 521 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  42.66 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  42.12 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  42.28 
 
 		 519 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  46.32 
 
 		 531 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  45.79 
 
 		 531 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  42.69 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  44.25 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  42.34 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  44.07 
 
 		 532 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  44.07 
 
 		 532 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  43.07 
 
 		 518 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  42.78 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  42.78 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  43.02 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  43.02 
 
 		 521 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  42.78 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  43.21 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  45.38 
 
 		 531 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  44.05 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  42.59 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  43.6 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  42.59 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  46.56 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  40.35 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  43.05 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  43.11 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  40.51 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  43.06 
 
 		 528 aa  347  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  38.33 
 
 		 516 aa  342  9e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  39.18 
 
 		 508 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  38.39 
 
 		 508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  39.47 
 
 		 509 aa  326  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  36.43 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  36.43 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  35.2 
 
 		 507 aa  320  3e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  38.07 
 
 		 505 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 		 505 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 		 505 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 		 505 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 		 505 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 		 505 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  38.07 
 
 		 505 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  40.49 
 
 		 504 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  37.78 
 
 		 506 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  37.86 
 
 		 505 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  38.62 
 
 		 533 aa  312  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  37.65 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  36.35 
 
 		 509 aa  309  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 		 526 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  37.83 
 
 		 520 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  36.74 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  36.16 
 
 		 535 aa  301  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  36.38 
 
 		 511 aa  299  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  39.72 
 
 		 537 aa  296  5e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  39.8 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  38.96 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 		 506 aa  290  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  35.14 
 
 		 502 aa  287  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  35.55 
 
 		 514 aa  287  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  39.14 
 
 		 517 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 		 499 aa  286  5.999999999999999e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  36.83 
 
 		 528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  35.14 
 
 		 511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  34.13 
 
 		 506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  34.96 
 
 		 511 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  35.4 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 		 552 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  34 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  34.95 
 
 		 505 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  34.62 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  36.9 
 
 		 513 aa  280  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  36.43 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  36.52 
 
 		 516 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  40.64 
 
 		 508 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  35.28 
 
 		 506 aa  276  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  35.33 
 
 		 567 aa  276  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  40.3 
 
 		 508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  36.3 
 
 		 536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  33.27 
 
 		 515 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  36.09 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  37.4 
 
 		 514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  34.34 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  38.57 
 
 		 518 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  34.17 
 
 		 489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  35.57 
 
 		 511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  34.95 
 
 		 513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  40.43 
 
 		 508 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  34.56 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  40.13 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  34.34 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  35.31 
 
 		 511 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  39.45 
 
 		 512 aa  273  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  36.94 
 
 		 514 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>