More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1457 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  100 
 
 		 139 aa  275  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  47.62 
 
 		 155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  43.2 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  44.52 
 
 		 195 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  39.52 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  41.73 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  40.32 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  43.26 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  39.52 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  42.52 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  43.44 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  43.09 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  38.93 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  40.8 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.69 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  37.8 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  38.84 
 
 		 183 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  44.35 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  39.67 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  38.17 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  39.39 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  43.31 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  43.09 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  41.98 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  38.13 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  40.48 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  40.48 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  40.48 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  39.06 
 
 		 165 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  40.98 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  42.4 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  41.3 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  42.37 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  38.35 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  34.9 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  40 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  40 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  40.16 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  41.94 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  39.84 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.2 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  38.58 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  39.37 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  39.52 
 
 		 153 aa  84.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  38.58 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  34.68 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  38.2 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  35.56 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  30.43 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  42.37 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  38.84 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  36.51 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  35.61 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  38.21 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  30.43 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  39.34 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  37.69 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  40.48 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  36.88 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  36.89 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3073  NusB antitermination factor  37.29 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  36.89 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  36.07 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  33.86 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  38.64 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  36.92 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  36.92 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  34.29 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  30.66 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  37.1 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  30.95 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  37.19 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  31.39 
 
 		 163 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  35.48 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>