More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3073 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3073  NusB antitermination factor  100 
 
 		 133 aa  266  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  46.74 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  36.44 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  47.25 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  43.48 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  39.32 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  43.48 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  43.48 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  43.48 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  43.48 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  28 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  41.49 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  38.32 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  40.82 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  30.47 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  36.07 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  31.45 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  36.44 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  29.1 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  37.38 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  30.6 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  28.97 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  29.85 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  34.15 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  37.61 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  38.14 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  32.26 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  37.89 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  32.5 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  34.43 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  31.33 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  30.89 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  34.75 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  33.7 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  42.39 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  38.71 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  36.67 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  32.26 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  36.89 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  35.23 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  36.08 
 
 		 171 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  37.11 
 
 		 163 aa  66.6  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  30.58 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  36.08 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  35.11 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  38.14 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  29.73 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  34.74 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  31.09 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3044  transcription antitermination protein NusB  35.04 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  35.35 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  31.36 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  32.38 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  31.46 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  32.5 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  34.95 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0424  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 294 aa  63.5  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.518961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  34.62 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  37.8 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  28.35 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  31.91 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  34.07 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  32.67 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  31.71 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  30.58 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  37.08 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  32.74 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  33.01 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  31.46 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2025  NusB antitermination factor  32.06 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0100858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  31.71 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  35.37 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>