More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0846 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 391 aa  759    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  51.96 
 
 		 389 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  51.7 
 
 		 389 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  51.7 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  50.79 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1446  hypothetical protein  52.86 
 
 		 390 aa  338  8e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.721087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  51.17 
 
 		 384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  44.56 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  48.81 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  42.75 
 
 		 389 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  42.42 
 
 		 418 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  39.95 
 
 		 415 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  42.18 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  43.77 
 
 		 405 aa  295  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  45.36 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  42.86 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  42.48 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  39.12 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  45.52 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  42.49 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  39.43 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  41.8 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  41.8 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  38.89 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  38.82 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  36.53 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  40.74 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  38.89 
 
 		 391 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  38.79 
 
 		 391 aa  269  8e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  39.04 
 
 		 394 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  38.89 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  38.1 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  40.5 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  41.12 
 
 		 407 aa  262  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  36.76 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  41.12 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  38.62 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  40.75 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  40.34 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  37.5 
 
 		 400 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  40.48 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  42.68 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  40.48 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  40.57 
 
 		 398 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  39.85 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  38.78 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  33.51 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  39.04 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  38.77 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  40.05 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  38.52 
 
 		 396 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  38.52 
 
 		 396 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  38.52 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  38.52 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  38.01 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  38.27 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  39.45 
 
 		 397 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  36.95 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  36.95 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  37.01 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  37.3 
 
 		 394 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  38.73 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  38.73 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  38.73 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  37.73 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  37.73 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  39.68 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  37.73 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  38.27 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  38.73 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  38.73 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  32.38 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  36.24 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  37.53 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  39.68 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  39.41 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  37.21 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  36.18 
 
 		 398 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  37.21 
 
 		 398 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  39.14 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  38.94 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  36.95 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  38.64 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  39.14 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  39.14 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  39.14 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  38.4 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  36.69 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  40.79 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  40.79 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  37.98 
 
 		 399 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  40.05 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  39.74 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  42.2 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  37.17 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  39.22 
 
 		 404 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  39.48 
 
 		 404 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  36.95 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  37.05 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  39.48 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>