More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0077 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.47 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.35 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  45.12 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0818672  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  38.74 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562893  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.04 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.09 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.09 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.09 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.87 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.65 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.74 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 249 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 		 249 aa  161  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  40.24 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  36.9 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.16 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  40.23 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.23 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.23 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.78 
 
 		 261 aa  158  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  36.25 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  38.49 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  38.89 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.7 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.26 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  39.29 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  38.1 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  38.1 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  38.1 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.94 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  38.1 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.96 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1040  short chain dehydrogenase  38.33 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.11 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.21 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>