293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3395 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
218 aa  420  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  98.62 
 
 
218 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.76 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.37 
 
 
209 aa  131  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.6 
 
 
230 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.92 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.81 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  37.31 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.32 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.97 
 
 
221 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2467  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.45 
 
 
238 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  39.9 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.53 
 
 
236 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.42 
 
 
232 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.11 
 
 
207 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.5 
 
 
234 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.63 
 
 
223 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5503  demethylmenaquinone methyltransferase protein  40.29 
 
 
217 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  normal  0.409875 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  38.33 
 
 
216 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.38 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.2 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  34.47 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.89 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  38.89 
 
 
222 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.1 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
229 aa  84.7  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  31.58 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  31.73 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  36.41 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  32.2 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  33.68 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  32.21 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.96 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  38.51 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.56 
 
 
437 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.65 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.01 
 
 
450 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.33 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.94 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.51 
 
 
438 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.17 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.51 
 
 
438 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.23 
 
 
438 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.47 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.04 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.14 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.42 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.84 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.95 
 
 
187 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.22 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.23 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  33.71 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3295  demethylmenaquinone methyltransferase  35.56 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.66 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  40.57 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.48 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.88 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  35.15 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.42 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  35.26 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.36 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1421  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.63 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  30.54 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  30.26 
 
 
225 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.56 
 
 
231 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  27.72 
 
 
235 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.46 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.52 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.39 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.12 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  36.48 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.68 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  33.7 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  36.43 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  33.18 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.15 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.75 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.1 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.52 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  30.84 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  27.69 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  32.72 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  31.67 
 
 
509 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  31.67 
 
 
509 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.84 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  32.31 
 
 
529 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  30.39 
 
 
532 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  32 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.38 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.18 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  29.35 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.85 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  35.53 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.38 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.38 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>