260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4271 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  60.91 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  48.61 
 
 
252 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  48.61 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  48.21 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  48.61 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  61.04 
 
 
249 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  47.01 
 
 
252 aa  207  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  48.4 
 
 
251 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  49.37 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  48.95 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  47.7 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  53.69 
 
 
258 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  53.69 
 
 
258 aa  195  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  54.66 
 
 
252 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  47.6 
 
 
248 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  41.77 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  37.85 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  38.34 
 
 
256 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  43.62 
 
 
252 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  38.96 
 
 
256 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  37.5 
 
 
261 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  39.37 
 
 
265 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 
252 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  41.73 
 
 
259 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 
252 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 
260 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  36.9 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  48.65 
 
 
247 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  38.65 
 
 
249 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  34.8 
 
 
271 aa  134  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  40.45 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  41.25 
 
 
253 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  39.73 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  39.2 
 
 
248 aa  131  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  41.4 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  36.44 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  46.37 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  39.48 
 
 
233 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  35.6 
 
 
246 aa  125  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  33.6 
 
 
247 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  39.26 
 
 
252 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  37.7 
 
 
249 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  36.1 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  38.59 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  33.89 
 
 
252 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  51.23 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  42.8 
 
 
256 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  39.08 
 
 
250 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  37.55 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  37.55 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  36.48 
 
 
245 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  34.77 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  37.7 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  31.71 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  34.5 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  36.95 
 
 
260 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  36.95 
 
 
260 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  36.84 
 
 
255 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  32.33 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  51.44 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  37.7 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  37.7 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  40.95 
 
 
253 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  35.14 
 
 
256 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  36.17 
 
 
253 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  36.48 
 
 
245 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 
260 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  34.13 
 
 
255 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  50.62 
 
 
257 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  38.46 
 
 
259 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  35.8 
 
 
246 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  36.53 
 
 
258 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  36.89 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  30.5 
 
 
262 aa  99  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  37.2 
 
 
247 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  31.4 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  33.73 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  36.03 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  33.74 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  38.4 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  37.05 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  38.86 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  34.26 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  31.6 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  40.35 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  33.64 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  38.43 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  30.74 
 
 
248 aa  88.6  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  30.58 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  27.94 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  33.58 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  25.3 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  35.11 
 
 
251 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>