More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3626 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  48.77 
 
 		 226 aa  177  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  44.1 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  44.62 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  44.62 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  45.05 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  49.47 
 
 		 245 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  46.23 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  45.23 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  46.56 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  41.18 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  42 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  43.27 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  41.5 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  44.16 
 
 		 222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  43.56 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  41.92 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  45.7 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  44.44 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  43.43 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  42.33 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  42.45 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  43.24 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  42.42 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  40.41 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  39.59 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  44.44 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  37.06 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  39.09 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  40.7 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  38.78 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  39.49 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  38.97 
 
 		 213 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  37.25 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  38.64 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  45.36 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  35.2 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  31.09 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  39.49 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 219 aa  87.8  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  38.32 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  32.77 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  33.88 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  32.2 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  32.2 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  32.77 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  38.04 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  34.86 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  33.51 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  40 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  33.33 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  35.15 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  30.54 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  37.32 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  40.43 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  40.43 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  39.16 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  27.01 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  30.22 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  37.58 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  35.37 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  33.51 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  38.61 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  30.85 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  28.21 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  31.1 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  29.38 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  37.99 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  36.47 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  38.99 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1700  methyltransferase GidB  28.3 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  34.2 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  31.93 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  29.94 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  34.08 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  37.41 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  28.35 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  36.87 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  41.18 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  37.58 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  36.07 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  33.71 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  33.52 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>