211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3378 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  621  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.53 
 
 		 279 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.43 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  52.63 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.44 
 
 		 301 aa  257  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  48.76 
 
 		 279 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.76 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.78 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.34 
 
 		 282 aa  242  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  45.36 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.44 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 287 aa  235  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  48.11 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.52 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.42 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  42.86 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 		 283 aa  225  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.96 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.04 
 
 		 290 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  40.14 
 
 		 289 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  42.21 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.31 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  42.16 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  40.75 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.97 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  39.8 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  42.81 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  38.46 
 
 		 272 aa  209  7e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.15 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  40.61 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.07 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  37.19 
 
 		 273 aa  200  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  43.69 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  40.7 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  42.96 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  38.62 
 
 		 292 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.79 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  37.28 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.63 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.18 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.86 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.01 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 		 260 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  36.62 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.3 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.69 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  31.71 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.23 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.15 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.52 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  29.72 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  32.12 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  34.08 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  28.67 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.87 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.87 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.87 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  32.43 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 		 345 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 		 362 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.98 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 358 aa  92.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2433  putative oxidoreductase protein  33.85 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.706626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.44 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  31.94 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 		 342 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0667  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 322 aa  85.9  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.91 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.91 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>