248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1775 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 270 aa  530  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1161  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.62 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700335  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0905  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.84 
 
 		 263 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0323401  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2671  hypothetical protein  52.23 
 
 		 273 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2940  condensin subunit ScpA  48.45 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1585  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.45 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230404  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.23 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.48 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1485  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.9 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991573  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1809  condensin subunit ScpA  50.59 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  50 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3932  condensin subunit ScpA  51.79 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0906  condensin subunit ScpA  47.24 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.04 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  47.84 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3025  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.23 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3191  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.1 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.762479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.18 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2792  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.76 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0379741  normal  0.0326469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.74 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0871  segregation and condensation protein A  47.97 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1804  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.28 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.259114  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2708  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.68 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.675497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4419  condensin subunit ScpA  47.08 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3121  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.19 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183261  normal  0.211142 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2347  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.58 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1141  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.39 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_004310  BR0880  segregation and condensation protein A  48.07 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.77 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1761  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.68 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1911  condensin subunit ScpA  45.52 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.88 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.67 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.455144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1092  condensin subunit ScpA  49.17 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2483  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.71 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.67 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.02 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.12 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  35.81 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.13 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.69 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  35.87 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  35.87 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  35.87 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  32.95 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  35.39 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.11 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  30.52 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.05 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.52 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.11 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.11 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.11 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  35.25 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  34.75 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  35.25 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  32.52 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.17 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.45 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.24 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.64 
 
 		 281 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.05 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.37 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.53 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.14 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.48 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.22 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.13 
 
 		 295 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  34.55 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.02 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.39 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  30.83 
 
 		 320 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.89 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  32.1 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.67 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.28 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  31.3 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.64 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  29.67 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  31.73 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.71 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  32.51 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  32.64 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.92 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  31.12 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.28 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  29.96 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.92 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  31.97 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.98 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.92 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  30.92 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.37 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>