171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1071 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
680 aa  1367    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  44.51 
 
 
275 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  40.48 
 
 
275 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  39.64 
 
 
449 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  39.64 
 
 
449 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  39.64 
 
 
449 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  35.54 
 
 
1392 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  38.75 
 
 
462 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  35.47 
 
 
279 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  33.17 
 
 
471 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  36.05 
 
 
279 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  36.05 
 
 
279 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.09 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.09 
 
 
643 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.03 
 
 
598 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  35.95 
 
 
304 aa  82.4  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.62 
 
 
622 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  34.66 
 
 
667 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.11 
 
 
624 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
532 aa  78.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.92 
 
 
622 aa  77.8  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.88 
 
 
595 aa  77.4  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.07 
 
 
723 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  35.91 
 
 
261 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 
312 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.34 
 
 
629 aa  77  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 
315 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.81 
 
 
738 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.6 
 
 
588 aa  75.1  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
658 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  32.8 
 
 
594 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  39.17 
 
 
647 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  33.09 
 
 
603 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  39.82 
 
 
317 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 
320 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  33.53 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  33.75 
 
 
581 aa  72.4  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  32.86 
 
 
633 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 
664 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
597 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 
648 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  27.88 
 
 
468 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  35.88 
 
 
411 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
306 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.77 
 
 
568 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  36.5 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  36.09 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
626 aa  68.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  28.3 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.39 
 
 
1149 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  35.83 
 
 
647 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.92 
 
 
647 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  35.83 
 
 
642 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2490  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.14 
 
 
277 aa  65.1  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  34.56 
 
 
301 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.2 
 
 
568 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 
275 aa  63.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  32.1 
 
 
652 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
805 aa  63.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
1148 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 
306 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 
310 aa  62.4  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  30 
 
 
553 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  30.46 
 
 
2132 aa  62  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
315 aa  60.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.4 
 
 
1139 aa  60.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  28.9 
 
 
299 aa  60.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
1151 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
1151 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1780  putative adenylate/guanylate cyclase  37.08 
 
 
189 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.37 
 
 
1138 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
304 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
308 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  28.99 
 
 
472 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  32.19 
 
 
316 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  31.09 
 
 
607 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.67 
 
 
1175 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.61 
 
 
634 aa  57.4  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
481 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.54 
 
 
596 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11143  hypothetical protein  31.58 
 
 
164 aa  57  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
1094 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 
1141 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 
425 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  24.72 
 
 
735 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 
612 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  23.96 
 
 
1105 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.82 
 
 
1048 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.13 
 
 
289 aa  54.3  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  32.5 
 
 
408 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.85 
 
 
1344 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.75 
 
 
1142 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>