More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1572 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 396 aa  793    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  77.3 
 
 		 402 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  71.03 
 
 		 406 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  71.03 
 
 		 406 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  70.71 
 
 		 405 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  56.6 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  56.17 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  61.28 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  38.62 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  39.22 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  34.52 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  42.86 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  35.52 
 
 		 334 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  34.3 
 
 		 326 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  35.77 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  36.25 
 
 		 326 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  35.77 
 
 		 326 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  36.25 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  36.25 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  36.1 
 
 		 326 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  34.92 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.88 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.88 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  36.19 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.88 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.88 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.88 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.88 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  34.15 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  34.52 
 
 		 325 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  39.78 
 
 		 337 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  34.93 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  33.46 
 
 		 524 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  38.22 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  36.48 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  37.41 
 
 		 207 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.76 
 
 		 803 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  31.54 
 
 		 528 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  30.39 
 
 		 781 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  31.72 
 
 		 814 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 880 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  34.93 
 
 		 882 aa  97.4  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  30.57 
 
 		 789 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.5 
 
 		 523 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  34.09 
 
 		 826 aa  96.7  6e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 792 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  32.05 
 
 		 846 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 786 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  29.56 
 
 		 809 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  33.16 
 
 		 433 aa  96.3  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  34.23 
 
 		 805 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  30.29 
 
 		 788 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36.67 
 
 		 772 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  30.21 
 
 		 815 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  34.23 
 
 		 798 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  32.45 
 
 		 853 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  31.39 
 
 		 797 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 		 783 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 825 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  29.78 
 
 		 936 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 824 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  29.78 
 
 		 936 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  30.29 
 
 		 788 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 805 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  32.28 
 
 		 791 aa  95.1  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  36.67 
 
 		 803 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  34.84 
 
 		 783 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  31.85 
 
 		 817 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  34.23 
 
 		 808 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  29.76 
 
 		 816 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 805 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  30.15 
 
 		 815 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  32.67 
 
 		 790 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  30.43 
 
 		 771 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  33.99 
 
 		 775 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  34.23 
 
 		 805 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  27.89 
 
 		 835 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  34.23 
 
 		 805 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  34.9 
 
 		 799 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  27.89 
 
 		 835 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 840 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  34.9 
 
 		 799 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  29.55 
 
 		 768 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  31.34 
 
 		 786 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  28.42 
 
 		 828 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  34.72 
 
 		 856 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  27.92 
 
 		 804 aa  93.6  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  32.93 
 
 		 800 aa  93.6  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  33.56 
 
 		 807 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  35.19 
 
 		 538 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  32 
 
 		 815 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  31.46 
 
 		 793 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 796 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 		 843 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 805 aa  93.2  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  34.44 
 
 		 898 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  32.48 
 
 		 810 aa  92.8  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  28.63 
 
 		 773 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  29.52 
 
 		 800 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  30.2 
 
 		 817 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>