More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4802 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4802  response regulator receiver protein  100 
 
 		 150 aa  302  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4061  putative response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.164869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0517  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  38.21 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355984  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3805  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7676  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  37.4 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3853  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.3 
 
 		 417 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3857  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3799  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  31.67 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0529  putative response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1496  response regulator and cylclic diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 413 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3494  diguanylate phosphodiesterase  37.82 
 
 		 393 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1870  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1493  response regulator receiver  35.09 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1528  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.83 
 
 		 479 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.163365  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0174  putative PAS/PAC sensor protein  28.04 
 
 		 498 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2620  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 532 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 685 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 869 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  28.8 
 
 		 240 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0068  two component Fis family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0341  two component transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 180 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2365  two component signal transduction response regulator  27.34 
 
 		 575 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 927 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 737 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4382  two component Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 681 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1876  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  32.43 
 
 		 416 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0109  two component Fis family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 466 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  30.23 
 
 		 239 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1161 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  28.1 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1091  two component transcriptional regulator  27.42 
 
 		 239 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0951  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  34.44 
 
 		 399 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.68 
 
 		 456 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.449732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 350 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 235 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2025  cyclic-di-GMP regulatory protein  28.57 
 
 		 390 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100945  normal  0.0489408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  23.08 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  25.62 
 
 		 235 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.97 
 
 		 494 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.97 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  25.62 
 
 		 235 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  25.62 
 
 		 235 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.52 
 
 		 276 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00294817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2171  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  29.75 
 
 		 408 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.189433  normal  0.293545 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.05 
 
 		 453 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 869 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1940  response regulator  27.78 
 
 		 397 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.2 
 
 		 239 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2943  helix-turn-helix, Fis-type  30.36 
 
 		 529 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0374645  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0989  DNA-binding response regulator  30.33 
 
 		 234 aa  47.4  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.016967  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1260  two component Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 473 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 841 aa  47.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  26.15 
 
 		 380 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0831  response regulator receiver:sigma-54 factor, interaction region  25.76 
 
 		 494 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  23.85 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1479  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.45 
 
 		 445 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 244 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  28.1 
 
 		 234 aa  45.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 		 721 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3383  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 475 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1207 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.35 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.95 
 
 		 460 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 491 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 1145 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1450  two component transcriptional regulator  32.18 
 
 		 226 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.37 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  29.75 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1874  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 		 575 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1184  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.9 
 
 		 738 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  30.38 
 
 		 393 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  31.75 
 
 		 226 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.38 
 
 		 393 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  25.38 
 
 		 380 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  25.41 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0964  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  26.23 
 
 		 478 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2550  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35149e-19 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0007  two component Fis family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3789  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 		 245 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0841995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0264  Signal transduction histidine kinase-like  31.96 
 
 		 666 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0904  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  22.76 
 
 		 479 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  25.19 
 
 		 263 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  24.39 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3252  response regulator  32.1 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  28.93 
 
 		 231 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.38 
 
 		 380 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 464 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  33.72 
 
 		 667 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>