More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4626 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  80.61 
 
 
597 aa  903    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  100 
 
 
592 aa  1195    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  48.16 
 
 
599 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  43.36 
 
 
630 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2774  peptidase M23B  32.82 
 
 
571 aa  240  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1247  Peptidase M23  30.88 
 
 
791 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0863  peptidase M23B  29.41 
 
 
809 aa  126  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000213309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  44.17 
 
 
379 aa  94  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  35.48 
 
 
514 aa  87.8  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  39.39 
 
 
312 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  46.46 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  38.54 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  43.1 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  38.64 
 
 
306 aa  84  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  44 
 
 
231 aa  84  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  46.46 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  36.89 
 
 
285 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  23.89 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  36.62 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  36 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  35.51 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  26.01 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  25 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  41 
 
 
308 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.32 
 
 
465 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.84 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  37.3 
 
 
293 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.97 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  44.79 
 
 
313 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  43 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  42.86 
 
 
254 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  37.41 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.72 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  35.38 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  38.61 
 
 
582 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  37.41 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  42.71 
 
 
419 aa  79  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  45.54 
 
 
503 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  37.1 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  40.57 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  35.38 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  38.84 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.53 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  37.41 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  43.69 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  41.82 
 
 
137 aa  77.8  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  34.25 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  35.97 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  44.21 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  37.07 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  41.67 
 
 
433 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  40.4 
 
 
448 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  41.67 
 
 
433 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  43.69 
 
 
402 aa  77  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  41.67 
 
 
433 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  41.67 
 
 
433 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.8 
 
 
312 aa  77  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  36 
 
 
282 aa  77  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.84 
 
 
300 aa  77  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  38.53 
 
 
465 aa  77  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  43.01 
 
 
390 aa  77  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.12 
 
 
375 aa  76.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.62 
 
 
569 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  33.73 
 
 
438 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  37.93 
 
 
375 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  41.67 
 
 
317 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  37.98 
 
 
346 aa  77  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  38.32 
 
 
457 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  40 
 
 
524 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  34.87 
 
 
453 aa  77  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  35.71 
 
 
404 aa  76.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  41.67 
 
 
431 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  41.67 
 
 
431 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  39 
 
 
417 aa  76.6  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  27.93 
 
 
269 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  37.07 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  45.19 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.45 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  41 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.44 
 
 
293 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  42.42 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  44.21 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  45.63 
 
 
320 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  32.8 
 
 
262 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  42.42 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  43.56 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  37.82 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.01 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  42.42 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  40.4 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  38.26 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  39.18 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.01 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  42.71 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  36.67 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  40.62 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  47.06 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  38.52 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  40 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>