21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3940 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1056    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  41.74 
 
 
582 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0641  hypothetical protein  45.01 
 
 
449 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0497  hypothetical protein  42.9 
 
 
368 aa  236  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1252  hypothetical protein  43.48 
 
 
371 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3312  hypothetical protein  41.54 
 
 
445 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  40.4 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1422  hypothetical protein  37.79 
 
 
443 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  0.126171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1198  hypothetical protein  48.3 
 
 
272 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6699  hypothetical protein  34.32 
 
 
415 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0092  hypothetical protein  44.24 
 
 
485 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538311  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.86 
 
 
964 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  34.18 
 
 
592 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.71 
 
 
964 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  34.19 
 
 
597 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.53 
 
 
950 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  41.98 
 
 
599 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  29.61 
 
 
630 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.97 
 
 
1072 aa  63.9  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1088  hypothetical protein  44.16 
 
 
310 aa  61.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.348315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2774  peptidase M23B  28.25 
 
 
571 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>