22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0050 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3312  hypothetical protein  77.4 
 
 		 445 aa  702    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  896    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0641  hypothetical protein  50 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  50 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  40.4 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0497  hypothetical protein  62.5 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1252  hypothetical protein  61.18 
 
 		 371 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6699  hypothetical protein  58.74 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1422  hypothetical protein  54.93 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  0.126171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1198  hypothetical protein  54.86 
 
 		 272 aa  162  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0092  hypothetical protein  48 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.14 
 
 		 964 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.18 
 
 		 964 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1088  hypothetical protein  45.05 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.348315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.64 
 
 		 950 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2774  peptidase M23B  32.11 
 
 		 571 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  28.76 
 
 		 599 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  29.05 
 
 		 680 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  31.96 
 
 		 597 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  26.53 
 
 		 592 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  28.72 
 
 		 630 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  36.62 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>