12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1422 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1422  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  897    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  0.126171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6699  hypothetical protein  46.15 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1198  hypothetical protein  65.77 
 
 
272 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  43.8 
 
 
582 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0092  hypothetical protein  56.05 
 
 
485 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538311  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  53.74 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0641  hypothetical protein  46.45 
 
 
449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3312  hypothetical protein  47.83 
 
 
445 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  38.17 
 
 
514 aa  160  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0497  hypothetical protein  40.33 
 
 
368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1252  hypothetical protein  40.79 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1088  hypothetical protein  45.83 
 
 
310 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.348315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>