16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6699 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6699  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  808    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1198  hypothetical protein  57.01 
 
 		 272 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1422  hypothetical protein  45.85 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  0.126171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0092  hypothetical protein  40.14 
 
 		 485 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  40.25 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0641  hypothetical protein  59.44 
 
 		 449 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  58.74 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3312  hypothetical protein  52.66 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1252  hypothetical protein  40.64 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0497  hypothetical protein  36.3 
 
 		 368 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  33.52 
 
 		 514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1088  hypothetical protein  45.39 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.348315  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0869  LasA protease precursor  38.33 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0779  LasA protease precursor  38.33 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.113695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2144  hypothetical protein  38.33 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00533951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1834  LasA protease precursor  36.67 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>