24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3616 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1187    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0641  hypothetical protein  52.58 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  50.5 
 
 
446 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3312  hypothetical protein  48.76 
 
 
445 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  40.21 
 
 
514 aa  293  8e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0497  hypothetical protein  42.37 
 
 
368 aa  207  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1252  hypothetical protein  41.69 
 
 
371 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1422  hypothetical protein  37.29 
 
 
443 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  0.126171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6699  hypothetical protein  40.65 
 
 
415 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1198  hypothetical protein  58.78 
 
 
272 aa  170  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0092  hypothetical protein  51.95 
 
 
485 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538311  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1088  hypothetical protein  38.79 
 
 
310 aa  87.8  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.348315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.03 
 
 
964 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.81 
 
 
964 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.17 
 
 
950 aa  67  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  29.75 
 
 
592 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  29.61 
 
 
599 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  30.38 
 
 
597 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2774  peptidase M23B  29.01 
 
 
571 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  34.48 
 
 
3193 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.12 
 
 
1072 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  30.53 
 
 
1123 aa  47.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  39.44 
 
 
2003 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4585  hypothetical protein  29.46 
 
 
1414 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>