13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0497 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0497  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  743    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1252  hypothetical protein  74.7 
 
 
371 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  41.79 
 
 
514 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  41.56 
 
 
582 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0641  hypothetical protein  60.26 
 
 
449 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  62.5 
 
 
446 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3312  hypothetical protein  62.5 
 
 
445 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1422  hypothetical protein  40.25 
 
 
443 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  0.126171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6699  hypothetical protein  36.21 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1198  hypothetical protein  46.54 
 
 
272 aa  126  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0092  hypothetical protein  42.14 
 
 
485 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538311  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1088  hypothetical protein  36.14 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.348315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.43 
 
 
964 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>