22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3312 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3312  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  895    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  76.68 
 
 		 446 aa  698    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0641  hypothetical protein  49.44 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  48.76 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  41.54 
 
 		 514 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0497  hypothetical protein  56.42 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1252  hypothetical protein  54.75 
 
 		 371 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6699  hypothetical protein  48.69 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1198  hypothetical protein  54.17 
 
 		 272 aa  156  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1422  hypothetical protein  51.41 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  0.126171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0092  hypothetical protein  48.47 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.19 
 
 		 964 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.04 
 
 		 950 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.97 
 
 		 964 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1088  hypothetical protein  46.05 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.348315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  30.2 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  29.49 
 
 		 599 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  28.19 
 
 		 597 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2774  peptidase M23B  34.55 
 
 		 571 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  33.7 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  25.47 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  36.14 
 
 		 3193 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>