69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2276 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  100 
 
 		 349 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  76.59 
 
 		 350 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  49.7 
 
 		 352 aa  301  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  45.09 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  43.15 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0171  putative RNA methylase  40 
 
 		 442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  hitchhiker  0.00204483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  38.17 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  35.6 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  31.27 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  31.67 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  34.57 
 
 		 379 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  31.14 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  30.43 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  28.12 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  29.45 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  31.4 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  28.78 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  25.57 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  30.2 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  25.58 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  21.46 
 
 		 381 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 254 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  21.46 
 
 		 381 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  22.75 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  27.01 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  28.1 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  30.33 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  27.36 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3255  RNA methylase family protein  22.22 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  28.1 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  27.5 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  26.56 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  20.99 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  30.36 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  24.64 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  24.62 
 
 		 385 aa  46.2  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00611  RNA methylase family protein  22.22 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  25.93 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  25 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  28.12 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.57 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  25.74 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  31.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  28.69 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  21.09 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  30.19 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 222 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  27.27 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  24.07 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  23.84 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.58 
 
 		 749 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  23.84 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.24 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.51 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.51 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.51 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  22.84 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  28.48 
 
 		 356 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 417 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2417  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.66 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 268 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0054  putative RNA methylase  22.96 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>