More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1895 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3824  CBS domain-containing protein  79.07 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 		 225 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  42.19 
 
 		 214 aa  94  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  42.22 
 
 		 225 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  36.43 
 
 		 220 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  39.37 
 
 		 216 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  39.37 
 
 		 216 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  38.58 
 
 		 256 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  34.65 
 
 		 223 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  37.8 
 
 		 214 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  34.68 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  37.98 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  39.37 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  45.05 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 215 aa  80.5  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  39.37 
 
 		 212 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  37.19 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  35.83 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  36.57 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  37.8 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  34.4 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  34.53 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35.71 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  35.61 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 		 246 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  36.43 
 
 		 503 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  35.66 
 
 		 214 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  34.88 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  35.14 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  35.38 
 
 		 380 aa  70.5  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  30.33 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  41.32 
 
 		 490 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  30.33 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.39 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  32.79 
 
 		 511 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  32.8 
 
 		 880 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  37.5 
 
 		 897 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  29.57 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 202 aa  67  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  31.78 
 
 		 214 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  35.71 
 
 		 867 aa  67  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  34.78 
 
 		 488 aa  67  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.58 
 
 		 282 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.56 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  36.29 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.09 
 
 		 769 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  38.26 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  32.52 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  31.34 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  32.81 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 315 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  38.05 
 
 		 375 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  31.11 
 
 		 233 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  30.89 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 		 386 aa  64.3  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  31.71 
 
 		 688 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  35.59 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.52 
 
 		 845 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 210 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  30.6 
 
 		 320 aa  63.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  27.87 
 
 		 513 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  36 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28.93 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 628 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  33.87 
 
 		 503 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  36.21 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  30.34 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.77 
 
 		 262 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.5 
 
 		 230 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  35.59 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  28.03 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.75 
 
 		 877 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  29.51 
 
 		 513 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 431 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  28.37 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  27.2 
 
 		 909 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.75 
 
 		 211 aa  60.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  31.01 
 
 		 888 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  37.7 
 
 		 640 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  36.7 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  27.66 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 		 241 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>