More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6381 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6381  inner-membrane translocator  100 
 
 		 313 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.736605  normal  0.121067 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  79.51 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  79.51 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  41.26 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  41.49 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 		 347 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3055  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100154  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  42.4 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.38 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2669  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.55 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.34 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.3 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  36.81 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  32.15 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  35.97 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  35.97 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  35.55 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  31.21 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  32.45 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  32.26 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.68 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.75 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.76 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.44 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1466  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.613245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 388 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  31.54 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.73 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  32.94 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  35.25 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  35.25 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  39.21 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.18 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  31.23 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.13 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  34.07 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  34.07 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  34.27 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  36 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 		 345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  35.59 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.46 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  30.64 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  31.08 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  29.08 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.55 
 
 		 341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.8 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  30.99 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  30.41 
 
 		 338 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>