250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3847 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  91.12 
 
 		 214 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2525  HhH-GPD family protein  56.81 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  55.87 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  55.87 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  55.87 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  55.87 
 
 		 219 aa  218  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  52.48 
 
 		 214 aa  197  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  47.44 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  45.19 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1134  putative DNA-3-methyladenine glycosidase  43.75 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3487  HhH-GPD  43.13 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  49.5 
 
 		 249 aa  164  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5238  HhH-GPD family protein  44.23 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0747  DNA-3-methyladenine glycosidase II  42.86 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  42.18 
 
 		 240 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4878  HhH-GPD family protein  48.11 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0924  HhH-GPD  42.18 
 
 		 243 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  47.03 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  45.05 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  41.23 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1964  HhH-GPD  41.75 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0340706  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  43.78 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  43.78 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  38.89 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1477  HhH-GPD family protein  31.19 
 
 		 199 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  37.62 
 
 		 368 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1445  HhH-GPD  33.18 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0863627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  31.46 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2665  HhH-GPD family protein  32.06 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2076  HhH-GPD family protein  42.29 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180031  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  36.14 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  36.87 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3945  HhH-GPD family protein  42.08 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.74 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  34.57 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.76 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  34.02 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  33.12 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  32.07 
 
 		 256 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  29.13 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  33.82 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.7 
 
 		 288 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.35 
 
 		 288 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  32.24 
 
 		 190 aa  94.7  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  29.9 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  32.07 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  32.07 
 
 		 349 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  32.63 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  31.52 
 
 		 261 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  30.98 
 
 		 291 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.43 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  30 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 340 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.43 
 
 		 312 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  29.57 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  29.89 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.43 
 
 		 312 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  29.89 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.43 
 
 		 295 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  30.43 
 
 		 312 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  30.43 
 
 		 312 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  30.43 
 
 		 312 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  32.97 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  28.72 
 
 		 287 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  30.43 
 
 		 312 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  31.84 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  33.73 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2525  HhH-GPD family protein  30.06 
 
 		 201 aa  85.1  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0239966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  31 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  30.98 
 
 		 287 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  30.93 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.43 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  27.66 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.66 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  26.98 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  30.43 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.43 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  27.66 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.43 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  27.66 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  27.51 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  29.1 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  29.59 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  32.04 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  29.1 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  30.48 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  27.13 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.15 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  27.13 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.82 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.82 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  45.05 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.33 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.24 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  28.19 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>