More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0476 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 330 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  85.76 
 
 		 330 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  61.11 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  67.37 
 
 		 293 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  49.29 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  43.11 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  50.7 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  49.48 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  46.4 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  45.49 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  46.4 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  34.53 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  40.5 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  36.56 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  38.87 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  34.6 
 
 		 330 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  36.68 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  35.29 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  33.22 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  34.83 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  34.49 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  36.43 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  34.49 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  32.39 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  34.71 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  35.56 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  35.05 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  32.13 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  31 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  34.4 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  32.03 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  32.98 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  31.25 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  32.53 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  33.45 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  32.62 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  35.29 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  34.64 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  31.93 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  28.67 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  30.03 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 		 306 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  29.93 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  31.83 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 310 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  31.21 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  29.19 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  31.13 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  32.61 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  30.48 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>