More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0194 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
619 aa  1254    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  33.13 
 
 
625 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  31.18 
 
 
627 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  34.61 
 
 
699 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
590 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  28.47 
 
 
704 aa  200  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  29.97 
 
 
697 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  36.94 
 
 
720 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  33.41 
 
 
715 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  34.63 
 
 
715 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 
683 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  31.37 
 
 
715 aa  158  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  33.01 
 
 
694 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 
636 aa  133  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.64 
 
 
645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.11 
 
 
659 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  28.57 
 
 
782 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86417  mitochondrial protein of the CDC48/PAS1/SEC18 family of ATPases  27.65 
 
 
703 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.36 
 
 
714 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  29.25 
 
 
784 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.11 
 
 
607 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.57 
 
 
510 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.21 
 
 
666 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  26.83 
 
 
715 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  27.21 
 
 
917 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.98 
 
 
662 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.21 
 
 
666 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.21 
 
 
666 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.21 
 
 
666 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  26.74 
 
 
700 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.21 
 
 
852 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.29 
 
 
605 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.98 
 
 
630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.57 
 
 
625 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  27.79 
 
 
759 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.98 
 
 
666 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  29.4 
 
 
637 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  29.14 
 
 
635 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.74 
 
 
618 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.72 
 
 
625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.61 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.95 
 
 
630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl672  cell division protein  28 
 
 
650 aa  115  3e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29 
 
 
631 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  29.05 
 
 
605 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.28 
 
 
623 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  27.42 
 
 
673 aa  114  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.09 
 
 
639 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  28.57 
 
 
633 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.33 
 
 
682 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.919885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.77 
 
 
607 aa  114  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.76 
 
 
614 aa  114  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1639  Vesicle-fusing ATPase  30.85 
 
 
503 aa  114  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.81 
 
 
667 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.33 
 
 
624 aa  114  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.86 
 
 
646 aa  113  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  28.33 
 
 
633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  28.33 
 
 
633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  28.33 
 
 
633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  28.33 
 
 
633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  28.33 
 
 
633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  28.99 
 
 
629 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  28.33 
 
 
633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  28.33 
 
 
633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.57 
 
 
621 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  28.09 
 
 
633 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.71 
 
 
696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.09 
 
 
633 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.71 
 
 
714 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.27 
 
 
647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.31 
 
 
635 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  31.09 
 
 
627 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.14 
 
 
697 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  27.58 
 
 
514 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.14 
 
 
697 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  31.44 
 
 
630 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  28.74 
 
 
646 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  29.33 
 
 
658 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  29 
 
 
633 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.4 
 
 
699 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.64 
 
 
610 aa  111  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.5 
 
 
630 aa  111  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  30.29 
 
 
659 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.61 
 
 
622 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.18 
 
 
610 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  30.11 
 
 
627 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.39 
 
 
610 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.81 
 
 
623 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  30.65 
 
 
708 aa  110  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.44 
 
 
634 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  29.37 
 
 
615 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  28.3 
 
 
628 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.94 
 
 
653 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.5 
 
 
614 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.71 
 
 
628 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.75 
 
 
611 aa  110  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26133  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  31.52 
 
 
677 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313854  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  27.17 
 
 
694 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  27.38 
 
 
640 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.66 
 
 
628 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>