284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5918 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  90.08 
 
 
495 aa  878    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  75.1 
 
 
495 aa  716    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  100 
 
 
497 aa  980    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  60.74 
 
 
497 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.27 
 
 
497 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  58.2 
 
 
549 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.07 
 
 
497 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.07 
 
 
497 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.62 
 
 
497 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  57.99 
 
 
549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  57.4 
 
 
534 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  57.7 
 
 
504 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  49.06 
 
 
513 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  51.45 
 
 
523 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  48.02 
 
 
513 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  48.86 
 
 
507 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  50.3 
 
 
500 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  48.45 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  48.03 
 
 
510 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  47 
 
 
507 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  38.45 
 
 
507 aa  319  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  37.18 
 
 
516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  39.5 
 
 
511 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  39.87 
 
 
509 aa  301  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  37.94 
 
 
508 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  41.06 
 
 
506 aa  292  9e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  39.05 
 
 
507 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
511 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  41.51 
 
 
499 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  41.51 
 
 
506 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  37.92 
 
 
509 aa  282  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  38.17 
 
 
507 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  38.95 
 
 
507 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  38.64 
 
 
510 aa  280  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  40.37 
 
 
518 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  40.53 
 
 
515 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  36.84 
 
 
519 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  37.32 
 
 
511 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  37.83 
 
 
510 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  39.62 
 
 
513 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 
511 aa  276  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 
515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  36.91 
 
 
514 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.54 
 
 
508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  41.78 
 
 
536 aa  273  7e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
507 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  41.72 
 
 
518 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  37.01 
 
 
510 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  38.05 
 
 
513 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  37.85 
 
 
512 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  38.05 
 
 
513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  38.05 
 
 
513 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  39.46 
 
 
526 aa  270  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  38.19 
 
 
513 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  39.37 
 
 
507 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  37.91 
 
 
513 aa  269  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  36.49 
 
 
508 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  37.81 
 
 
498 aa  269  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  39.37 
 
 
507 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  38.77 
 
 
506 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  37.76 
 
 
510 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  37.58 
 
 
513 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 
510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  40.57 
 
 
518 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  37.37 
 
 
513 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  38.95 
 
 
507 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  37.66 
 
 
510 aa  266  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  39.53 
 
 
507 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
514 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  38.43 
 
 
511 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  39.26 
 
 
517 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  40.35 
 
 
518 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  38.56 
 
 
507 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  36.15 
 
 
520 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  41.16 
 
 
509 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  38.02 
 
 
511 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  36.84 
 
 
538 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 
508 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  37.81 
 
 
506 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  36.55 
 
 
511 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  41.31 
 
 
517 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  38.95 
 
 
507 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  38.95 
 
 
507 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 
508 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  35.7 
 
 
523 aa  259  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  37.14 
 
 
510 aa  259  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  36.15 
 
 
506 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  37.05 
 
 
515 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 
524 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  39.17 
 
 
507 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  38.96 
 
 
507 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  42.25 
 
 
508 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  40.47 
 
 
516 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  38.96 
 
 
507 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  38.96 
 
 
533 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  38.96 
 
 
529 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  38.96 
 
 
529 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>