91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5154 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  65.27 
 
 
168 aa  230  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  36.42 
 
 
236 aa  90.5  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  40.41 
 
 
197 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  37.8 
 
 
197 aa  87.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  36.08 
 
 
199 aa  84.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  36.18 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  32.67 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  36.89 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  32.67 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2523  hypothetical protein  32.54 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  32.26 
 
 
223 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  25.97 
 
 
232 aa  57.4  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  32.56 
 
 
229 aa  57.4  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  31.1 
 
 
215 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  31.36 
 
 
214 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  32.73 
 
 
215 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  32.8 
 
 
227 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  28.57 
 
 
252 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  28.24 
 
 
226 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.81 
 
 
222 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  30.67 
 
 
220 aa  54.3  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  29.61 
 
 
238 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.57 
 
 
240 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  34.78 
 
 
257 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  32.33 
 
 
219 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  32.85 
 
 
246 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  28.48 
 
 
236 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  27.91 
 
 
243 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  33.09 
 
 
241 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  31.71 
 
 
248 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  29.38 
 
 
230 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  24.83 
 
 
212 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  33.1 
 
 
244 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  23.57 
 
 
212 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  28.31 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  30.84 
 
 
201 aa  51.6  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  30.66 
 
 
208 aa  51.2  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  30.07 
 
 
221 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  34 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  27.67 
 
 
238 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  35.96 
 
 
232 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  30.28 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  31.75 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  29.48 
 
 
247 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  35 
 
 
232 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  22.86 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  22.86 
 
 
212 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  28.98 
 
 
244 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  34.45 
 
 
215 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.19 
 
 
242 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  27.22 
 
 
346 aa  47.4  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  25.62 
 
 
216 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  26.15 
 
 
218 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  26.72 
 
 
218 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  25.3 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  27.48 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  26.95 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  25.38 
 
 
215 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  27.54 
 
 
217 aa  45.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  25.6 
 
 
256 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  31.85 
 
 
222 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 
224 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  25.16 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  34.19 
 
 
217 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  34.19 
 
 
217 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  31.58 
 
 
233 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  22.09 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4430  hypothetical protein  27.71 
 
 
206 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  22.6 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  28.22 
 
 
253 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  28.33 
 
 
233 aa  42.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  22.6 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  27.78 
 
 
261 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  26.14 
 
 
227 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  27.81 
 
 
222 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  30.91 
 
 
244 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  26.43 
 
 
224 aa  41.6  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  26.89 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  25.17 
 
 
222 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  25.71 
 
 
212 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  32 
 
 
226 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0786  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0758  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  30.43 
 
 
244 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.68 
 
 
233 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  27.21 
 
 
206 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  27.12 
 
 
210 aa  40.8  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  26.81 
 
 
222 aa  40.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>