More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5073 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  100 
 
 
387 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  62.06 
 
 
389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  52.29 
 
 
379 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  49.47 
 
 
390 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  49.2 
 
 
387 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  51.21 
 
 
388 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.28 
 
 
389 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 
394 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  50 
 
 
394 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  49.87 
 
 
387 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  50 
 
 
394 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  49.73 
 
 
392 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  49.2 
 
 
387 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  50 
 
 
394 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  49.6 
 
 
387 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.74 
 
 
394 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  49.74 
 
 
396 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  49.74 
 
 
396 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  49.74 
 
 
396 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  49.33 
 
 
387 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 
394 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  49.74 
 
 
396 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  49.48 
 
 
396 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  49.74 
 
 
396 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.74 
 
 
396 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  49.74 
 
 
396 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  49.47 
 
 
394 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  49.47 
 
 
387 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  50.26 
 
 
389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 
387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  49.07 
 
 
387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  51.77 
 
 
395 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  47.59 
 
 
387 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  49.6 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  51.23 
 
 
395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  49.21 
 
 
395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  49.87 
 
 
407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  46.93 
 
 
406 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  49.73 
 
 
388 aa  354  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.49 
 
 
389 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  47.34 
 
 
399 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  49.21 
 
 
399 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  49.21 
 
 
399 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  49.21 
 
 
396 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  48.27 
 
 
391 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  47.85 
 
 
425 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  48.95 
 
 
396 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  47.24 
 
 
393 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  47.62 
 
 
402 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  49.6 
 
 
399 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  46.74 
 
 
399 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.95 
 
 
396 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 
396 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  50.53 
 
 
389 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  51.21 
 
 
373 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  44.53 
 
 
412 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  48.27 
 
 
391 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  47.84 
 
 
389 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  46.67 
 
 
405 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  47.03 
 
 
391 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  48.42 
 
 
396 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  47.63 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.08 
 
 
388 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  49.86 
 
 
395 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  43.93 
 
 
397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  49.86 
 
 
395 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  49.86 
 
 
395 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.19 
 
 
403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  47.11 
 
 
396 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  43.93 
 
 
397 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  45.91 
 
 
394 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  45.91 
 
 
394 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  47.11 
 
 
396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  46.7 
 
 
396 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  46.32 
 
 
396 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  48.03 
 
 
398 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  45.38 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  43.65 
 
 
402 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  45.16 
 
 
403 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  44.71 
 
 
387 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  44.66 
 
 
387 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  46.63 
 
 
398 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  46.44 
 
 
394 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  46.17 
 
 
394 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  43.67 
 
 
396 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  43.67 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  43.12 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  48.42 
 
 
753 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  48.42 
 
 
395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  48.42 
 
 
395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  48.42 
 
 
395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  48.42 
 
 
395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  41.6 
 
 
383 aa  319  5e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  48.42 
 
 
395 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  43.39 
 
 
401 aa  319  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  43.92 
 
 
387 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  44.85 
 
 
391 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  42.25 
 
 
398 aa  318  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  43.41 
 
 
396 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  42.13 
 
 
383 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>