More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3254 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  97.08 
 
 
343 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  77.84 
 
 
343 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  77.55 
 
 
342 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  74.34 
 
 
343 aa  524  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  74.64 
 
 
343 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  74.34 
 
 
343 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  68.8 
 
 
314 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  61.05 
 
 
342 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  60.64 
 
 
343 aa  408  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  60.06 
 
 
342 aa  401  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  59.48 
 
 
341 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  58.89 
 
 
341 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  59.18 
 
 
341 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  56.56 
 
 
340 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  58.89 
 
 
341 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  58.33 
 
 
337 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  55.36 
 
 
345 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  55.98 
 
 
337 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  57.74 
 
 
337 aa  362  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  56.25 
 
 
337 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  56.55 
 
 
337 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  55.1 
 
 
337 aa  335  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  55.1 
 
 
337 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  53.91 
 
 
338 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  47.04 
 
 
375 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  50.61 
 
 
329 aa  292  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  45.32 
 
 
326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  41.62 
 
 
374 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  47.32 
 
 
342 aa  279  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.57 
 
 
348 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  44.57 
 
 
362 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  49.38 
 
 
463 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  49.35 
 
 
525 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  49.35 
 
 
525 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  48.48 
 
 
525 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  50 
 
 
648 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  46.34 
 
 
784 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  49.59 
 
 
799 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  42.96 
 
 
427 aa  212  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 
266 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  38.12 
 
 
256 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  29.18 
 
 
289 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  37.86 
 
 
179 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  32.37 
 
 
287 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  30.63 
 
 
323 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  32.92 
 
 
291 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 
272 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  35.23 
 
 
299 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  30.62 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 
257 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.6 
 
 
263 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  43.86 
 
 
249 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  41.32 
 
 
280 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  29.95 
 
 
245 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 
271 aa  89.7  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  42.15 
 
 
242 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 
271 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  31.51 
 
 
266 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  43.44 
 
 
251 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  27.76 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  40.52 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
246 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
269 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 
257 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  43.22 
 
 
261 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 
248 aa  86.3  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  41.07 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 
259 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  35.1 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  40.5 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  37.4 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  34.59 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  31.73 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  37.58 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  32.95 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  26.59 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  42.74 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  39.13 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  42.61 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  41.6 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  37.16 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  39.26 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  36.59 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  39.17 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.24 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  37.01 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  37.12 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  28.47 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>