More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3165 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3165  amidohydrolase  100 
 
 
389 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  83.51 
 
 
389 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  90.98 
 
 
389 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3241  peptidase M20D, amidohydrolase  70.44 
 
 
391 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0177418  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  52.39 
 
 
389 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  50.13 
 
 
387 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  49.35 
 
 
387 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  49.35 
 
 
387 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.96 
 
 
387 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  48.96 
 
 
387 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  48.83 
 
 
387 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  49.22 
 
 
387 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  52.31 
 
 
390 aa  352  7e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  47.94 
 
 
390 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.28 
 
 
412 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.22 
 
 
396 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.63 
 
 
397 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  49.47 
 
 
396 aa  348  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  47.94 
 
 
387 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  49.21 
 
 
396 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  49.21 
 
 
396 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  49.21 
 
 
396 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.6 
 
 
397 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  49.21 
 
 
396 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  47.79 
 
 
387 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 
397 aa  345  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.41 
 
 
394 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.94 
 
 
396 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.94 
 
 
396 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.94 
 
 
396 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.04 
 
 
396 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  50.26 
 
 
399 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.41 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.41 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.41 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  46.72 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.48 
 
 
397 aa  342  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.11 
 
 
398 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  45.69 
 
 
423 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  48.15 
 
 
394 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.53 
 
 
394 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.15 
 
 
394 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.6 
 
 
425 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  44.42 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  48.44 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  49.87 
 
 
401 aa  336  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  45.43 
 
 
402 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.83 
 
 
396 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.18 
 
 
399 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  50.26 
 
 
384 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 
415 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.83 
 
 
415 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  49.34 
 
 
392 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.94 
 
 
403 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.73 
 
 
396 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.58 
 
 
395 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.31 
 
 
406 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  45.55 
 
 
401 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  43.89 
 
 
404 aa  328  8e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.95 
 
 
391 aa  328  8e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  44.82 
 
 
403 aa  328  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  48.06 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  47.67 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  48.27 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  47.03 
 
 
389 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  47.16 
 
 
388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  48.81 
 
 
396 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  46.23 
 
 
387 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  47.41 
 
 
391 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  45.76 
 
 
388 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  47.94 
 
 
399 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  47.94 
 
 
399 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  47.59 
 
 
390 aa  322  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  48.06 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  50.26 
 
 
407 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.4 
 
 
389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  49.21 
 
 
402 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  47 
 
 
397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48.54 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  47.55 
 
 
396 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  46.67 
 
 
399 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  47.68 
 
 
396 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.12 
 
 
379 aa  318  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  47.8 
 
 
391 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  46.06 
 
 
390 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  46.38 
 
 
395 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  47.31 
 
 
385 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  49.24 
 
 
417 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  47.19 
 
 
388 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  47.89 
 
 
394 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  46.7 
 
 
399 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  43.78 
 
 
425 aa  316  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  47.53 
 
 
385 aa  316  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  45.36 
 
 
396 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  44.56 
 
 
387 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  47.48 
 
 
396 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  49.35 
 
 
398 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  46.17 
 
 
389 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  44.3 
 
 
387 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>