More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1770 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1770  ABC transporter related  100 
 
 		 405 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636101  decreased coverage  0.00357448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1669  ABC transporter related  62.1 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1183  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.56 
 
 		 392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0969985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1086  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.29 
 
 		 392 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.34 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.08 
 
 		 391 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  46.83 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0177  ABC transporter related  48.68 
 
 		 385 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3148  ABC transporter related  48.53 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7593  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.93 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0132  ABC transporter related  48.52 
 
 		 384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  44.27 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  44.65 
 
 		 359 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  44.53 
 
 		 353 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  44.41 
 
 		 361 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  42.45 
 
 		 365 aa  292  9e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  46.3 
 
 		 362 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  44.24 
 
 		 359 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  45.04 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  43.9 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  42.89 
 
 		 361 aa  286  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.97 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  42.01 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0960  ATPase  45.07 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.284254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 364 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  44.44 
 
 		 380 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  45.41 
 
 		 357 aa  282  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  45.61 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  45.77 
 
 		 353 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  42.67 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  43.58 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  43.58 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  43.58 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  39.85 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  42.53 
 
 		 365 aa  280  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  41.8 
 
 		 355 aa  279  6e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.79 
 
 		 349 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.18 
 
 		 359 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  41.8 
 
 		 355 aa  279  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  46.71 
 
 		 356 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.18 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0510  ATPase  42.97 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136787  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.54 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  41.82 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.04 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 355 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  42.06 
 
 		 370 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.79 
 
 		 349 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  44.26 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.07 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  40.51 
 
 		 385 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  43.47 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  44.67 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  44.41 
 
 		 351 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  43.7 
 
 		 369 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  44.55 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  44.65 
 
 		 349 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  46.22 
 
 		 380 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  44.28 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  44.28 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  47.02 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1103  ABC transporter related  43.82 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  47.02 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  42.6 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  42.09 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  43.85 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  43.8 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  43.04 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.16 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  42.42 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4396  ABC transporter related  40.85 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.625138  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3448  ABC transporter related  46.57 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  43.35 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  44.06 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  41.16 
 
 		 369 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  40.74 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  44.88 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0430  ABC transporter related protein  41.79 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  43.7 
 
 		 415 aa  272  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  45.4 
 
 		 368 aa  272  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 370 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  43.31 
 
 		 381 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  48.06 
 
 		 375 aa  272  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  44.33 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  43.3 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  45.24 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  42.78 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  41.07 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  43.16 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  45.78 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  38.66 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  42.04 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  42.04 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  43.31 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  42.22 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  41.28 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>