More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5710 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  76.15 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  74.81 
 
 		 276 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  74.81 
 
 		 276 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  76.33 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  60.07 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  58.82 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  58.3 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  55.6 
 
 		 272 aa  310  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  32.89 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  25.5 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  25.5 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  28.28 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  25.74 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  27.17 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  27.5 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  28.73 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  27.97 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  27.97 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  27.59 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 843 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0794  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 843 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 844 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  27.59 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  27.2 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  27.2 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  27.2 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  27.2 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  27.2 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  26.32 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  45.31 
 
 		 1067 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 907 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  75.76 
 
 		 944 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  25.82 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  69.7 
 
 		 842 aa  55.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 908 aa  55.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 907 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  26.85 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 917 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  71.88 
 
 		 962 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 907 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 909 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  76.67 
 
 		 993 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 908 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 908 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  76.47 
 
 		 970 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  71.88 
 
 		 962 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  71.88 
 
 		 962 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  68.97 
 
 		 845 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 908 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 907 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  26.46 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  26.46 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  26.46 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  52.5 
 
 		 997 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 904 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 908 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 908 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 911 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 920 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 908 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 904 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 906 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 904 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 908 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 907 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  81.82 
 
 		 901 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 901 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  26.07 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  81.82 
 
 		 918 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 897 aa  53.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 910 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 899 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 945 aa  53.5  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 902 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 900 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 915 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  81.82 
 
 		 901 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 1004 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 897 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 924 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 916 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 930 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  72 
 
 		 919 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 917 aa  52.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 917 aa  52.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0289  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 903 aa  52.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.703701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>