54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4425 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  40.83 
 
 		 342 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  73.33 
 
 		 360 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  75.29 
 
 		 378 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  36.54 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  45.32 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  31.79 
 
 		 317 aa  118  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  35.36 
 
 		 296 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  29.24 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  35.1 
 
 		 345 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  33.09 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  49.06 
 
 		 421 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  54.55 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  41.27 
 
 		 351 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  44.26 
 
 		 338 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  37.66 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  55.95 
 
 		 341 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  55.95 
 
 		 341 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  55.95 
 
 		 341 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  55.95 
 
 		 341 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  55.95 
 
 		 341 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  55.95 
 
 		 341 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  55.95 
 
 		 334 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  55.95 
 
 		 341 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  49.41 
 
 		 380 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  44.83 
 
 		 309 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  53.66 
 
 		 351 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  53.66 
 
 		 351 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  53.66 
 
 		 351 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  53.66 
 
 		 351 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  42.28 
 
 		 344 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  46.43 
 
 		 347 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  48.81 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  48.81 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  30.58 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  45.26 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  40.59 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  37.08 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  38.66 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  30.54 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  32.94 
 
 		 274 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  40 
 
 		 353 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3323  protein TolA  26.32 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.672074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  30.7 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  31.87 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.8 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1712  hypothetical protein  25.41 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0852036  hitchhiker  0.00264543 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  34.33 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  34.33 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0749  transcriptional regulator, Fis family  22.34 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0027337  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  30.77 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  22.85 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  46.67 
 
 		 264 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  46.34 
 
 		 264 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>