107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3379 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  50.77 
 
 
661 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  50.93 
 
 
661 aa  679    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  52.5 
 
 
653 aa  661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  51.3 
 
 
617 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  100 
 
 
653 aa  1350    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  49.69 
 
 
1290 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  52.71 
 
 
648 aa  677    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  51.39 
 
 
663 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  56.2 
 
 
657 aa  751    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  50.7 
 
 
660 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  71.3 
 
 
662 aa  1006    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  52.16 
 
 
651 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  52.16 
 
 
651 aa  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  51.92 
 
 
675 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  50.93 
 
 
653 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  52.01 
 
 
654 aa  683    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  53.36 
 
 
654 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  47.92 
 
 
660 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  51.46 
 
 
621 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  52.54 
 
 
653 aa  680    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  51.66 
 
 
631 aa  661    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.62 
 
 
661 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.46 
 
 
661 aa  681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  49.37 
 
 
667 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  49.46 
 
 
658 aa  680    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  49.77 
 
 
659 aa  691    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  51.42 
 
 
677 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  50.62 
 
 
661 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  51.18 
 
 
658 aa  691    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  50.54 
 
 
661 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  53.07 
 
 
652 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  51.11 
 
 
648 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  51.9 
 
 
661 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  50.38 
 
 
655 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  50.46 
 
 
661 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  50.77 
 
 
661 aa  677    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  56.17 
 
 
656 aa  797    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  58.11 
 
 
655 aa  820    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  59.84 
 
 
657 aa  819    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  56.73 
 
 
657 aa  798    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  49.68 
 
 
636 aa  631  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  51.66 
 
 
629 aa  634  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  51.86 
 
 
626 aa  629  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  50.98 
 
 
611 aa  621  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  50.15 
 
 
641 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  47.69 
 
 
658 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  51.14 
 
 
625 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  47.69 
 
 
658 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  50.63 
 
 
625 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  50.63 
 
 
625 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  48.94 
 
 
628 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  50.48 
 
 
625 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  47.16 
 
 
673 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  45.66 
 
 
696 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  47.87 
 
 
654 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  44.04 
 
 
670 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  43.06 
 
 
701 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  43.29 
 
 
691 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  42.74 
 
 
680 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  42.59 
 
 
687 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  48.21 
 
 
609 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  45.03 
 
 
655 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  44.36 
 
 
653 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  45.12 
 
 
669 aa  547  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  46.82 
 
 
645 aa  537  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  44.1 
 
 
704 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  43.77 
 
 
704 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  44.39 
 
 
659 aa  534  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  44.07 
 
 
607 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  42.99 
 
 
668 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  42.26 
 
 
700 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.31 
 
 
666 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  43.24 
 
 
661 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  43.31 
 
 
673 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.15 
 
 
663 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  42.9 
 
 
663 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
662 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
662 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  41.82 
 
 
662 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  42.52 
 
 
662 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  41.88 
 
 
657 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 
683 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 
595 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  30.47 
 
 
635 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  40.06 
 
 
357 aa  263  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
591 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  46.19 
 
 
225 aa  191  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  29.93 
 
 
491 aa  184  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 
441 aa  180  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 
444 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  23.54 
 
 
477 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  22.53 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  58.73 
 
 
67 aa  77.4  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  22.91 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  22.83 
 
 
417 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  22.07 
 
 
417 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 
417 aa  61.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  21.98 
 
 
417 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>