206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3562 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3562  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  651    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.300874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1355  regulatory protein GntR, HTH  80 
 
 		 317 aa  498  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  24.92 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3158  regulatory protein GntR, HTH  26.35 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 115 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 127 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 122 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1267  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 337 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 132 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  51.06 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.11 
 
 		 472 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 128 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 133 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 470 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 470 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 470 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 		 159 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.49 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.84 
 
 		 469 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  23.05 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  22.17 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  22.17 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  26.01 
 
 		 240 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2976  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 129 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2105  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  40 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.158429 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  22.56 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  42.86 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.67 
 
 		 444 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 128 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  24.11 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 129 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5646  regulatory protein GntR HTH  43.86 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  46.67 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  46.67 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  39.24 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 248 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 125 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 126 aa  46.2  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  24.28 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  24.28 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 139 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  38.33 
 
 		 234 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 120 aa  45.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  29.55 
 
 		 243 aa  45.8  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 139 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 480 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0099  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  38.55 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  24.28 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  51.11 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0767  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  24.28 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 139 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  28.17 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  23.5 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  40.35 
 
 		 121 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  40.38 
 
 		 75 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  38.55 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 139 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  37.5 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  44.9 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6099  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  45.45 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 121 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  24.28 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.26 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  29.06 
 
 		 139 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 478 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>