More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18471 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  93.29 
 
 
328 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  100 
 
 
328 aa  671    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  90.85 
 
 
328 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  85.06 
 
 
328 aa  584  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  73.7 
 
 
328 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  71.17 
 
 
333 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  70.43 
 
 
329 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  70.86 
 
 
333 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  69.6 
 
 
329 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  69.51 
 
 
329 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  51.53 
 
 
327 aa  355  5e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  45.87 
 
 
331 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
327 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  46.22 
 
 
328 aa  302  6.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  44.79 
 
 
325 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
327 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  44.38 
 
 
329 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  44.38 
 
 
329 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  35.53 
 
 
156 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 
131 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
480 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 
159 aa  63.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
126 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  40.24 
 
 
509 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 
128 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.87 
 
 
501 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  26.36 
 
 
126 aa  60.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.24 
 
 
504 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.24 
 
 
507 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 
129 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
501 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
496 aa  59.3  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
146 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
502 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
502 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  24.81 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  33.33 
 
 
502 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  28.75 
 
 
467 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
546 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
564 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
503 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
562 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
564 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  41.18 
 
 
503 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
502 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  41.18 
 
 
561 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  41.18 
 
 
564 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  41.18 
 
 
502 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
564 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
512 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
477 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.3 
 
 
468 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  38.82 
 
 
523 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.78 
 
 
490 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 
125 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
490 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  29.6 
 
 
126 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  29.6 
 
 
126 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
121 aa  57  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.74 
 
 
494 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
473 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  36.59 
 
 
122 aa  56.6  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 
506 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.49 
 
 
494 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.33 
 
 
495 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  44.78 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  39.71 
 
 
520 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
137 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 
120 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  39.47 
 
 
488 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
121 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  25.78 
 
 
122 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 
126 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
126 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
504 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
133 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
255 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.08 
 
 
501 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.58 
 
 
485 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.66 
 
 
503 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
133 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
132 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 
120 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.03 
 
 
471 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09150  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 
454 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
513 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3130  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
356 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467751  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  38.46 
 
 
121 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.21 
 
 
515 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  33.67 
 
 
223 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  35.8 
 
 
125 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.67 
 
 
485 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0208  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
466 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>