50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2814 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  100 
 
 
676 aa  1367    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  93.34 
 
 
676 aa  1296    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  44.1 
 
 
644 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  41.87 
 
 
656 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  38.3 
 
 
737 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  42.98 
 
 
647 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  40.15 
 
 
647 aa  462  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  40.77 
 
 
649 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  42.98 
 
 
653 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  41.08 
 
 
650 aa  437  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  41.45 
 
 
650 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  38.95 
 
 
652 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  38.9 
 
 
706 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  34.97 
 
 
785 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  31.86 
 
 
677 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  30.81 
 
 
651 aa  214  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  27.88 
 
 
692 aa  205  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  31.61 
 
 
1008 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  28.86 
 
 
649 aa  171  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  28.87 
 
 
1203 aa  170  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  29.17 
 
 
1119 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  28.79 
 
 
1080 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  26.93 
 
 
1101 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  53.21 
 
 
843 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  32.66 
 
 
796 aa  124  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  31.68 
 
 
854 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  32.24 
 
 
730 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  45.98 
 
 
289 aa  95.1  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  39.23 
 
 
760 aa  91.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  29.84 
 
 
957 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  29.96 
 
 
833 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  27.78 
 
 
1183 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  33.96 
 
 
469 aa  64.7  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  26.98 
 
 
1088 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  28.37 
 
 
469 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  33.96 
 
 
469 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  26.6 
 
 
833 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  30.11 
 
 
503 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  28.85 
 
 
503 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  27.76 
 
 
1168 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  37.5 
 
 
814 aa  55.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  25.39 
 
 
1289 aa  54.7  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  25.66 
 
 
986 aa  53.5  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4278  Baseplate J family protein  26.03 
 
 
423 aa  53.5  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  27.2 
 
 
1413 aa  52.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  27.03 
 
 
1030 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  26.64 
 
 
1236 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  27.97 
 
 
1744 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  27.07 
 
 
1235 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  23.77 
 
 
1007 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>