More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2113 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  100 
 
 		 387 aa  794    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  78.76 
 
 		 439 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  73.32 
 
 		 439 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  74.61 
 
 		 439 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 443 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  41.71 
 
 		 438 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  39.85 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 437 aa  262  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 437 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 446 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  37.63 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 447 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 		 439 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  33.68 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  32.47 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  27.62 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  27.42 
 
 		 473 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 494 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  28.15 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  28.39 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  27.81 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 459 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  27.42 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.95 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.88 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  26.88 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.68 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  26.88 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.88 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  29.4 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.88 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  27.62 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 494 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 494 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  27.42 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 477 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 475 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 471 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 428 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 435 aa  99.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  28.85 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  27.56 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 472 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 482 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  28.85 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  25 
 
 		 429 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 435 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>