52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0734 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  100 
 
 		 345 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  70.4 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  67.24 
 
 		 342 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  42.73 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  35.1 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  34.18 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  44.06 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  32.38 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  33.33 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  34.39 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  57.14 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  43.38 
 
 		 296 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  44.44 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  52.68 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  52.68 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  52.68 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  41.6 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  41.41 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  41.6 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  41.73 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  51.18 
 
 		 355 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  50.82 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  50.39 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  53.27 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  38.58 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  44.58 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  48.06 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  43.68 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  52.27 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  52.27 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  52.27 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  52.27 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  52.27 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  52.27 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  52.27 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  46.24 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  42.05 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  44.83 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  36.75 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  36.26 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  38.52 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  40.74 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  42.03 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.14 
 
 		 925 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.66 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  30.19 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  28.97 
 
 		 317 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  37.14 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  35.8 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  37.69 
 
 		 570 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  50 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  25.29 
 
 		 279 aa  42.7  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>