82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3667 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  100 
 
 		 2078 aa  3982    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  98.27 
 
 		 3634 aa  3703    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  34.53 
 
 		 3486 aa  712    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  38.91 
 
 		 8918 aa  661    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  33.3 
 
 		 1989 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  33.79 
 
 		 4896 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  38.08 
 
 		 2912 aa  355  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1946 aa  278  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  39.26 
 
 		 1441 aa  275  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  38.45 
 
 		 1898 aa  267  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  40.06 
 
 		 1809 aa  240  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  37.99 
 
 		 2853 aa  207  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  38.74 
 
 		 2886 aa  202  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  31.03 
 
 		 3920 aa  183  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  25.32 
 
 		 2487 aa  156  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  24.85 
 
 		 2490 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  24.9 
 
 		 2490 aa  152  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  24.5 
 
 		 2490 aa  145  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  26.18 
 
 		 2490 aa  145  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  25.34 
 
 		 2490 aa  145  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  25.42 
 
 		 2358 aa  139  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  25.26 
 
 		 2485 aa  138  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  25.37 
 
 		 2358 aa  137  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  24.61 
 
 		 2489 aa  131  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  23.29 
 
 		 2520 aa  125  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  22.83 
 
 		 2520 aa  120  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  25.11 
 
 		 2490 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  23.05 
 
 		 2121 aa  116  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1665 aa  112  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  39.78 
 
 		 3191 aa  97.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  38.53 
 
 		 3771 aa  94.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  31.1 
 
 		 3360 aa  91.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  24.76 
 
 		 5010 aa  90.5  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  24.22 
 
 		 5010 aa  90.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  24.55 
 
 		 5017 aa  89.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  24.97 
 
 		 5017 aa  89.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  24.55 
 
 		 5017 aa  89.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  36.26 
 
 		 801 aa  89  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  23.68 
 
 		 1857 aa  88.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  24.87 
 
 		 5017 aa  87  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  31.75 
 
 		 924 aa  86.3  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  23.11 
 
 		 5010 aa  84.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  38.69 
 
 		 2487 aa  83.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  32.17 
 
 		 3793 aa  83.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  28.89 
 
 		 2604 aa  82  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 4897 aa  79.3  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  23.37 
 
 		 1533 aa  78.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  24.14 
 
 		 5017 aa  77.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  38.21 
 
 		 1021 aa  76.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  23.23 
 
 		 2113 aa  75.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  24.01 
 
 		 5010 aa  75.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  38.12 
 
 		 3927 aa  69.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1580 aa  69.3  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  23.73 
 
 		 3602 aa  66.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  26.81 
 
 		 2434 aa  65.9  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  26.32 
 
 		 2118 aa  63.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  26.97 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1757 aa  60.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  28.85 
 
 		 1015 aa  58.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  30.91 
 
 		 1168 aa  57  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 1118 aa  56.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  26.87 
 
 		 978 aa  53.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  33.5 
 
 		 440 aa  53.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20420  conserved repeat domain protein  25.38 
 
 		 1248 aa  53.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  25.11 
 
 		 2573 aa  53.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  26.27 
 
 		 3409 aa  52.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  26.67 
 
 		 2000 aa  52  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  26.87 
 
 		 3472 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_205  hypothetical protein  31.76 
 
 		 653 aa  51.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5567  von Willebrand factor type A  28.96 
 
 		 684 aa  50.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  26.2 
 
 		 2418 aa  50.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  23.42 
 
 		 3521 aa  50.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  25.67 
 
 		 3471 aa  49.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  28.9 
 
 		 1150 aa  49.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  34.74 
 
 		 3921 aa  49.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.86 
 
 		 2713 aa  48.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.95 
 
 		 2724 aa  47.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1702 aa  48.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  37.04 
 
 		 643 aa  48.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2055  hypothetical protein  37.29 
 
 		 214 aa  47.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  27.35 
 
 		 1293 aa  46.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  27.27 
 
 		 898 aa  45.8  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>