284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3574 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 523 aa  1032    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  98.47 
 
 		 523 aa  1017    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  44.8 
 
 		 530 aa  352  8e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  40.59 
 
 		 533 aa  316  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  34.98 
 
 		 513 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  40.72 
 
 		 509 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  38.79 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  37.15 
 
 		 516 aa  309  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  35.49 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  38.85 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  34.77 
 
 		 512 aa  299  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  38.92 
 
 		 511 aa  300  6e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  41.43 
 
 		 535 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  36.4 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  33.73 
 
 		 511 aa  293  5e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 		 507 aa  292  9e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  32.09 
 
 		 506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  38.91 
 
 		 508 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  35.82 
 
 		 505 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  35.37 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  35.37 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  37.6 
 
 		 540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  38.48 
 
 		 517 aa  272  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  38.82 
 
 		 715 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  38.32 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  40.34 
 
 		 526 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  34.49 
 
 		 505 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  33.88 
 
 		 506 aa  270  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  38.22 
 
 		 511 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  36.52 
 
 		 538 aa  269  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  36.76 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  33.88 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  37.21 
 
 		 540 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  37.35 
 
 		 511 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  37.63 
 
 		 498 aa  269  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  37.1 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  33.87 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  33.68 
 
 		 505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  33.94 
 
 		 505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  33.74 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  33.74 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  33.74 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  33.67 
 
 		 505 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  37.32 
 
 		 514 aa  266  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  39.24 
 
 		 509 aa  266  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  39.6 
 
 		 514 aa  266  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 		 506 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  36.62 
 
 		 514 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  39.35 
 
 		 513 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  39.35 
 
 		 513 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  39.35 
 
 		 513 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  36.54 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  38.24 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  38.24 
 
 		 507 aa  264  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  35.94 
 
 		 540 aa  264  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  37.93 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  39.91 
 
 		 515 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  39 
 
 		 534 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  39.75 
 
 		 507 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 507 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  40.18 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 507 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 533 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  38.98 
 
 		 513 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  38.93 
 
 		 513 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 507 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 507 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  39.01 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  39.01 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  39.22 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  36.63 
 
 		 513 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  36.59 
 
 		 510 aa  261  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  38.82 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  37.65 
 
 		 510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  38.65 
 
 		 513 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  39.78 
 
 		 515 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  38.93 
 
 		 514 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  37.84 
 
 		 509 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  38.32 
 
 		 507 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  38.12 
 
 		 507 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  39.39 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  37.84 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  38.12 
 
 		 507 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  35.6 
 
 		 519 aa  257  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  35.76 
 
 		 528 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  37.89 
 
 		 507 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 		 510 aa  257  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  37.83 
 
 		 512 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  39.57 
 
 		 515 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  36.23 
 
 		 520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  37.97 
 
 		 511 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  36.33 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  36.01 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>