59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2355 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  100 
 
 		 116 aa  244  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  62.28 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  63.06 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  56.36 
 
 		 113 aa  126  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  55.86 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  53.7 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  48.7 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  50.67 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  42.61 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  51.28 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  53.75 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  53.75 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0335  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  41.18 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2023  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  41.18 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  46.15 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  38.94 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  45.68 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  45.24 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  50 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1722  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  40.2 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  43.43 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  47.22 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0864  Restriction endonuclease protein  40.38 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  47.13 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  40.82 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  51.43 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  50 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  40.79 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  37.25 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  39.18 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  34.29 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  43.24 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  43.24 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  39.18 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  49.28 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  44.59 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  44.59 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  53.06 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  65.79 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  42.86 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  32.04 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  44.29 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  33.73 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  32.18 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  32.89 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 135 aa  43.9  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  27.68 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  29.91 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  33.82 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 132 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>