59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05315 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  100 
 
 		 417 aa  836    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  82.25 
 
 		 421 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  82.25 
 
 		 421 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  64.5 
 
 		 423 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  64.23 
 
 		 416 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  63.96 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  59.09 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  63.23 
 
 		 419 aa  458  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  63.96 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  61.4 
 
 		 419 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  63.96 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  63.96 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  61.4 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  63.69 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.6 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.08 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.98 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.82 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.52 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.77 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 415 aa  192  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  29.63 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  24.62 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  25.42 
 
 		 401 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  28.81 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3869  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.45 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4329  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.22 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.113261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  25.99 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5856  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.26 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  28.48 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.89 
 
 		 481 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3929  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.37 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.69 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4437  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.37 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.93 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.93 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.52 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.52 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  27.06 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  25.32 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.48 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.52 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.52 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.48 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.52 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.71 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.29 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  24.92 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  27.38 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  23.1 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  21.14 
 
 		 545 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0018  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1233 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  29.09 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12450  hypothetical protein  31.48 
 
 		 933 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277877  normal  0.37002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>