More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4938 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 366 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  68.73 
 
 		 367 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  68.23 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  65.41 
 
 		 368 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  64.93 
 
 		 364 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  61.62 
 
 		 369 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  63.1 
 
 		 362 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  47.14 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  32.37 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  36.39 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  33.14 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  44.65 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  32.56 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  31.81 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 		 354 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  45.16 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  40.28 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  39.81 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.88 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  32.91 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 317 aa  99.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.95 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  30.7 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  29.95 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 196 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 		 471 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 		 399 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 436 aa  93.2  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 		 403 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  29.75 
 
 		 401 aa  93.2  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 		 348 aa  92.8  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 		 402 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 		 1073 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 		 404 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 212 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00476  two-component system regulatory protein with HD-GYP domain  35.76 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  34.84 
 
 		 770 aa  90.9  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  27.34 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 400 aa  90.1  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  32.28 
 
 		 419 aa  89.7  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 448 aa  89.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 		 402 aa  89.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 619 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 		 698 aa  89.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 439 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 		 1313 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3290  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 		 202 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 338 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  29.49 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 		 713 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1333 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  26.97 
 
 		 563 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0523  Response regulator protein  24.22 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63210  putative two-component response regulator  27.88 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0175  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 271 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0157005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 562 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  35.33 
 
 		 771 aa  86.3  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  25.38 
 
 		 362 aa  86.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  26.82 
 
 		 564 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  32.28 
 
 		 427 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 		 651 aa  86.3  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.15 
 
 		 353 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 1237 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  30.11 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  34.25 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>