228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2505 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 191 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  51.65 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  51.32 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  44.02 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.31 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  41.62 
 
 		 195 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  42.05 
 
 		 198 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  41.58 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  38.25 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 237 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 200 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.47 
 
 		 378 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.76 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 159 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  32.26 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  36.96 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.53 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  31.35 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.81 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  30.81 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.31 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  37.86 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  30.81 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 366 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  27.12 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.78 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  27.78 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.28 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.28 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.28 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 		 440 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.28 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.28 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  28.28 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  23.94 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  35.77 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.4 
 
 		 382 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.61 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.02 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  32.33 
 
 		 391 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 448 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22.82 
 
 		 442 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24 
 
 		 442 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  29.25 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.29 
 
 		 443 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.02 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.67 
 
 		 442 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  26.71 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  29.79 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>