More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2443 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 		 383 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  78.07 
 
 		 383 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  76.76 
 
 		 383 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  76.76 
 
 		 383 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  77.28 
 
 		 383 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  74.67 
 
 		 383 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  65.8 
 
 		 383 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  69.78 
 
 		 385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  64.36 
 
 		 392 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  59.47 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  58.68 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  58.68 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  57.49 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  55.64 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  51.52 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  53.31 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  58.95 
 
 		 384 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  51.93 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  57.18 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.59 
 
 		 374 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  53.04 
 
 		 381 aa  342  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  50.84 
 
 		 367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  46.81 
 
 		 379 aa  318  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  47.38 
 
 		 379 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  47.66 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  47.38 
 
 		 379 aa  298  8e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  41.85 
 
 		 373 aa  285  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.67 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  42.11 
 
 		 367 aa  276  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.91 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.57 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  35.79 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.83 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.91 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.53 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.08 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.02 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  37.67 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  37.8 
 
 		 376 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.88 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  38.4 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  38.44 
 
 		 355 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  36.41 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  36.62 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.97 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  36.01 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.77 
 
 		 355 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  37.43 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.64 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.77 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.59 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.29 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.65 
 
 		 441 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.87 
 
 		 444 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.64 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.03 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  34.44 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  33.15 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  34.13 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  38.27 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  32.4 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32 
 
 		 377 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  42.04 
 
 		 494 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  36.91 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  31.78 
 
 		 353 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.06 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.77 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  28.77 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.97 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.26 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.3 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.3 
 
 		 420 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  28.3 
 
 		 420 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  28.3 
 
 		 420 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  28.3 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.07 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  28.3 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.07 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.61 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.98 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.12 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  32.45 
 
 		 370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.08 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.09 
 
 		 451 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  39.58 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  31.59 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  34.32 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  28.91 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  33.59 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  27.36 
 
 		 419 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.86 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  30.88 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  30.05 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.16 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  31.44 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  31.45 
 
 		 345 aa  150  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  31.99 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  31.64 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  38.14 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>