244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0870 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  77.08 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  62.3 
 
 		 222 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  63.87 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  41.08 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  37.06 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  36.07 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  39.8 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  40.3 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  38.92 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  38.92 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  38.31 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  39.46 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  34.56 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  34 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  36.62 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  39.39 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  36.7 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  40.54 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  35.5 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  34.24 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  31.13 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  34 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  35.94 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  38.64 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  37.43 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  29.35 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  37.78 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  31.91 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  38.16 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  38.16 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  37.36 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  33 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  33.33 
 
 		 235 aa  98.2  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  32.82 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  38.41 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 284 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  34.31 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  33.17 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  38.32 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  33.64 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4118  flagellar hook capping protein  39.16 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  34.25 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0693  flagellar hook capping protein  34.48 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  34.74 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3964  flagellar hook capping protein  37.35 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  30.19 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1878  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  33.91 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  31.15 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  32.54 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0601  flagellar hook capping protein  33.54 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0985  flagellar hook capping protein  33.9 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459314 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  28.28 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  34.98 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  28.49 
 
 		 293 aa  85.5  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  38.75 
 
 		 280 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  38.75 
 
 		 280 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  38.75 
 
 		 277 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  38.75 
 
 		 277 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  38.75 
 
 		 277 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  38.75 
 
 		 277 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  38.75 
 
 		 280 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  35.26 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  32.93 
 
 		 221 aa  84.7  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  35.26 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  35.26 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  35.26 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  31.98 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  36.31 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  35.26 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  36.93 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  34.62 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  35.26 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  31.01 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  30.99 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  39.33 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  33.97 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  39.33 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  30.32 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1494  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  29.09 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  35.06 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  29.3 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  31.87 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  34.52 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  38 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  36.6 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  37.5 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  36.42 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  38.67 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  30.54 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  30.81 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  30.24 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  30.24 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  29.33 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  30.24 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>